分子诊断能够通过一系列的分子生物学方法,对机体及外来病原体的核酸物质或其相应的表达水平进行检测,可应用于传染病、遗传病、肿瘤等疾病的诊断或辅助治疗。在这些应用领域,分子诊断技术弥补了传统诊断方法的不足,为疾病预防、诊断、治疗监测及预后评估提供了重要证据。本文就分子诊断发展历程及其在传染性疾病、肿瘤及无创产前检测领域的应用现状及发展趋势进行分析。
分子诊断行业发展历程
分子诊断行业的发展历程大体可以划分为四个阶段。
(一)第一阶段:DNA分子杂交技术在遗传病基因诊断上的应用
1953年,由科学家Watson和Crick所构建的脱氧核糖核酸双螺旋结构模型开启了分子生物学形成和发展的篇章。此后,分子生物学研究不断取得进展,1978年,液相DNA分子杂交技术在镰形细胞贫血症诊断上的成功应用,极大推动了疾病诊断领域的发展,也为分子诊断拉开了蓬勃发展的序幕。
在分子诊断的初期阶段,基因诊断被应用于对遗传病的判定,即通过对胚胎期婴儿的产前诊断,更早期地预知一些遗传病的发生和后续的发展、预后。
(二)第二阶段:PCR技术在疾病诊断领域的广泛应用
1985年,由化学家KaryMullis发明的PCR技术的出现,给分子诊断领域带来了新的概念,推动传统基因诊断向更为全面的分子诊断发展,同时也标示着分子诊断进入新的发展阶段。
随后,基于PCR技术平台,越来越多的PCR应用技术被专家学者开发出来,如巢式PCR(nestedPCR)、反转录PCR(reversetranscriptionPCR)和实时荧光定量PCR与数字PCR(digitalPCR)等。其中,实时荧光定量PCR是目前应用最为广泛的PCR技术,其在基因工程、分子生物学以及其他DNA鉴定相关领域中应用广泛,尤其是在疾病检测与诊断方面。另外,在临床应用和商品检疫环节,以及新药开发和法医鉴定方面也被普遍应用。
(三)第三阶段:生物芯片技术引领密集型高通量检测技术的发展
从1992年世界上第一张基因芯片在美国Affymetrix公司问世到现在,芯片技术已经得到长足的发展。芯片按结构分类,可分为基于微阵列(microarray)的杂交芯片与基于微流控(microfluidic)的反应芯片。
传统的核酸印迹杂交技术在自动化程度和检测通量上都相对落后,同时也更为复杂,检测的目标分子数量也相对更少。生物芯片技术很好地解决了这些不足,其能够通过特定的分析方法和探针阵列,实现众多不同方面的应用,从针对基因突变和多态性的分析检测,到基因表达谱的测定,再到基因组文库作图和杂交测序等。这些都有力地助推了基因功能研究、现代医学科学和医学诊断学的快速发展;相关应用也已在基因诊断和药物筛选、个性化给药等方面有了极高的价值体现。
(四)第四阶段:高通量测序技术成为临床分子诊断的重要工具
1977年,第一代DNA测序技术在双脱氧末端终止法(由SangerF等发明)和化学降解法(由MaxamAM、GilbertW等发明)相继确立的背景下诞生。并在之后的20余年里,助力科学家完成了大量的测序工作,实现从噬菌体到人类基因组图谱的绘制。但第一代DNA测序技术在成本、速度以及实验复杂程度等方面都存在着很多的不足,这些都极大限制了其应用的范围。
自2000年初开始,第二代测序技术的出现推动了测序技术的快速发展。第二代测序技术又称高通量测序(NGS)技术,相比第一代测序技术,具有所需样本量小、总体成本低的特点,能够通过一次实验对多个基因完成检测。NGS技术可应用于病原微生物的快速鉴定、药物的靶向治疗以及产前筛查等领域。
我国分子诊断行业发展概况
我国分子诊断技术最早出现在20世纪六七十年代,80年代主要是以点杂交、Southern印迹杂交等为代表的技术。PCR技术在90年代开始逐步得到推广和应用,随之也带动分子诊断技术在国内快速发展,并开始进入临床实验室。目前我国分子诊断行业正处于分子诊断发展的第三个阶段,生物芯片技术正协同PCR技术共同发展,助推分子诊断行业快速发展。
我国分子诊断技术虽起步较晚,但发展速度高于全球。近几年分子诊断市场更是迎来前所未有的发展机遇。市场规模总值从2013年的25.4亿元增长至2019年的132.1亿元,年复合增长率达到31.63%,增长态势迅猛。虽然仅占全球市场规模的16.86%,但增速约为全球增速的2.6倍。
目前,我国在PCR技术方面发展成熟,已基本达到国际先进水平。截至2020年底,我国共有1320项分子诊断产品获批,其中70%是基于PCR技术的分子诊断产品。因此,目前PCR技术仍是国内主流的分子检测平台。
分子诊断应用广泛,应用领域主要包括:(1)感染性疾病及耐药的快速、灵敏诊断;(2)生殖健康的遗传病检测;(3)肿瘤的早期诊断、分子分型及靶向治疗;(4)药物基因组学。
(一)国内感染性疾病检测市场
感染性疾病的检测在国内分子诊断领域发展最早,也是市场占比最大的领域。乙型肝炎病毒核酸检测、丙型肝炎病毒核酸检测、新型冠状病毒核酸检测等领域占据国内感染性疾病分子诊断领域的主要份额。近五年,国内分子诊断市场发展最为迅猛的是血源病原体核酸筛查和新型冠状病毒核酸检测两大领域。
血源病原体核酸筛查(检测HBVDNA、HCVRNA和HIVRNA)是在政府政策推动下而得到迅速发展的一个分子诊断领域。分子诊断的优势和作用也在该领域得到了充分的显现,相比于仅采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测HBsAg、抗HCV以及抗HIV(1+2型)+P24抗原,核酸筛查HBVDNA、HCVRNA和HIVRNA可以进一步缩短病原体感染机体后的检测“窗口期”,规避病原体突变等因素造成的ELISA漏检,并增加对隐匿性感染者的筛查覆盖。血源病原体核酸筛查极大地提高了临床用血及血液制品的安全性。
我国自2010年开始在15家血液中心进行了临床用血的病原体核酸筛查试点工作。2013年,原国家卫生计生委印发了关于推进血站核酸检测的实施方案,血站核酸检测工作开始在全国范围内推广实施。到2015年底,国内临床用血基本实现了病原体核酸筛查全覆盖。基于此工作的实施,临床用血的病原体核酸筛查市场也在2013年开始得到快速扩张(见图1)。2016年,原国家卫生计生委会同原国家食品药品监督管理总局进一步印发了《关于促进单采血浆站健康发展的意见》,要求至2019年底实现单采血浆站核酸检测全覆盖,血源病原体核酸筛查市场进一步快速扩展。可预见的是,随着全国无偿献血人次的逐年增长(2019年达到1563万人次,2020年受新冠疫情影响,预估献血人次将首次出现下滑;与发达国家相比及临床用血需求来看,献血人次后续仍将保持增长态势)和单采血浆站采浆规模(2019年近8820吨,较2015年增加47%,2020年采浆规模同样受新冠疫情影响,预估规模与2019年持平或略微下滑,从我国人均年采浆次数和未来可增设浆站的空间来看,采浆规模的增幅空间仍较大)的逐年扩大,血源核酸筛查市场也将呈现稳步增长的态势。